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過(guò)去兩年有一項大熱的技術(shù),大量研究人員通過(guò)這項技術(shù)解決重要科學(xué)問(wèn)題,發(fā)表了大量高水平學(xué)術(shù)文章,這項技術(shù)便是單細胞測序技術(shù)。
單細胞測序技術(shù),在這兩年得到了蓬勃發(fā)展。一些高通量的單細胞測序平臺開(kāi)始為大家所熟知。有10×genomics單細胞測序平臺、以及Fluidigm、WaferGen、Illumina/Bio-Rad等。
這些平臺在很大程度上降低了單細胞測序的成本,使得單個(gè)細胞的測序成本變得極低。雖然單個(gè)細胞的成本降低了,但一個(gè)樣本需要產(chǎn)生大量細胞的數據,所以單個(gè)樣本的成本并沒(méi)有很低。大多數的研究者會(huì )因這幾十萬(wàn)甚至上百萬(wàn)的測序成本而對單細胞測序研究望而卻步。有些希望從事單細胞研究或者希望提供單細胞測序服務(wù)的單位,也會(huì )因為測序平臺高昂的價(jià)格而猶豫不決。
在這種形式下,上海凈信潛心研發(fā)兩年多,重磅推出了國內家,quan球第五家的單細胞測序平臺。*國內在單細胞測序平臺制造上的空白。該平臺基于Drop-seq的技術(shù)原理,能夠一次完成數千甚至上萬(wàn)細胞的單細胞測序。
大家所熟知的10×genomics單細胞胞測序平臺依托的技術(shù)手段稱(chēng)之為inDrop-seq,論文在2015年發(fā)表與Cell雜志。該方法利用微液滴技術(shù)將帶有條形碼、索引分子、引物及其他的凝膠珠與單細胞混合。每個(gè)液滴內開(kāi)展逆轉錄反應,以產(chǎn)生測序所用的帶有條形碼的cDNA。
10×genomics單細胞測序平臺原理圖
有意思的是,凈信使用的Drop-seq技術(shù)與inDrop-seq技術(shù)發(fā)表與同一期的Cell雜志上。Drop-seq也是利用微流控技術(shù)將細胞分開(kāi),并與帶有特定條形碼的磁珠混合。磁珠上的Poly(dT)將細胞內的信使RNA捕獲。收集磁珠凈信逆轉錄和擴增,得到測序所用的帶有條形碼的cDNA。與inDrop-seq不同的是,Drop-seq的逆轉錄的過(guò)程是在液滴外進(jìn)行的,這樣逆轉錄的效率會(huì )更高。
凈信單細胞測序儀原理圖
凈信的單細胞測序儀不管是從原理還是從測試結果看,都完quan能媲美進(jìn)口儀器。它每個(gè)樣本能夠產(chǎn)生5000~10000個(gè)細胞,對上機樣本的要求不再那么嚴苛。為防止實(shí)驗失敗造成的損失,機器還特別添加了能夠監控實(shí)驗過(guò)程的系統,一旦出現管道堵塞等情況,便可以及時(shí)止損。而關(guān)鍵的還是:該平臺不論是從機器的購買(mǎi)成本,還是試劑耗材的成本都非常低。該平臺的問(wèn)世,再次將單細胞測序的價(jià)格拉低了一個(gè)臺階,使得更多的研究人員能夠去利用這一先進(jìn)的技術(shù)手段進(jìn)行研究工作。
凈信單細胞測序儀 樣機圖
凈信誠邀各大測序公司、醫療及技術(shù)服務(wù)公司一起合作,為單細胞測序的發(fā)展貢獻力量。